يجد أليكس ، مارتي ، وحيوانات حيوانات أخرى طريقة للهروب من مدغشقر عندما تعيد طيور البطريق تجميع الطائرة المحطمة. تبقى المركبة التي تم إصلاحها غير مستقرة جواً لفترة طويلة بما يكفي للوصول بها إلى القارة الأفريقية. هناك يواجه سكان نيويورك أعضاء من الأنواع الخاصة بهم لأول مرة. أفريقيا تثبت أنها مكان جامح ، ولكن أليكس والشركة تتسائلان عما إذا كانا أفضل من منزلهما في سنترال بارك.
