يجتمع `` كاي '' و''جاي '' لتوفير أفضل خط دفاع لنا وأخيرًا ضد المغرية الشريرة التي تواجه أصعب تحدٍ حتى الآن لبيان مهمة MIB غير الصعبة - حماية الأرض من حثالة الكون. لقد مرت أربع سنوات منذ أن تجنب العملاء الباحثون عن أجسام كارثة بين المجرات ذات أبعاد أسطورية. الآن هو سباق مع الزمن حيث يجب على جاي إقناع كاي - الذي ليس لديه أي ذكرى على الإطلاق لقضاء وقته مع MIB ، ولكنه أيضًا الشخص الحي الوحيد المتبقي لديه الخبرة لإنقاذ المجرة - لم شمله مع MIB قبل تخضع الأرض لدمار مطلق.